Tự động hóa phân tích 10x Genomics Cloud thông qua Neotask trên Neotask
Khởi chạy và giám sát các quy trình phân tích giải trình tự đơn bào
Duyệt, tải xuống và sắp xếp các bộ dữ liệu và kết quả genomics
Truy vấn siêu dữ liệu thí nghiệm và chia sẻ kết quả giữa các nhóm
Những gì bạn có thể làm
Neotask kết nối với 10x Genomics Cloud thông qua Neotask, mang đến cho các nhà nghiên cứu khả năng điều khiển bằng hội thoại đối với các quy trình làm việc genomics đơn bào và không gian - mà không cần điều hướng qua các bảng điều khiển phức tạp.
Quản lý quy trình phân tích
Khởi chạy quy trình phân tích - Kích hoạt các quy trình làm việc Cell Ranger, Space Ranger hoặc Loupe Browser bằng cách mô tả các thông số thí nghiệm của bạn bằng tiếng Anh đơn giản
Giám sát trạng thái chạy - Kiểm tra quy trình nào đang chạy, đang chờ hoặc đã hoàn tất và hiển thị bất kỳ lỗi nào mà không cần đăng nhập vào bảng điều khiển đám mây
Truy xuất kết quả - Lấy các đầu ra phân tích, chỉ số QC và báo cáo tóm tắt cho các lần chạy đã hoàn tất
Chạy lại các công việc thất bại - Xác định các bước quy trình thất bại và gửi lại với các thông số đã sửa
Thao tác bộ dữ liệu
Duyệt bộ dữ liệu - Liệt kê tất cả các bộ dữ liệu trong không gian làm việc của bạn được lọc theo dự án, loại mẫu hoặc ngày
Tải xuống đầu ra - Lấy các tệp kết quả cụ thể như ma trận đặc trưng-mã vạch đã lọc hoặc đầu ra hình ảnh mô
Sắp xếp dự án - Tạo thư mục dự án, di chuyển bộ dữ liệu và duy trì quy ước đặt tên nhất quán ở quy mô lớn
So sánh thí nghiệm - Lấy siêu dữ liệu từ nhiều lần chạy để so sánh số lượng tế bào, độ sâu giải trình tự và các chỉ số chất lượng cạnh nhau
Cộng tác & Báo cáo
Chia sẻ bộ dữ liệu - Tạo liên kết chia sẻ hoặc thêm cộng tác viên vào các dự án cụ thể
Xuất bản tóm tắt - Lấy bản tóm tắt thí nghiệm ở định dạng có cấu trúc cho báo cáo hoặc công cụ phân tích hạ nguồn
Theo dõi nguồn gốc mẫu - Truy vấn mẫu nào đến từ thư viện nguồn nào và phiên bản phân tích nào đã được sử dụng
Thử hỏi
"Hiển thị cho tôi tất cả các lần chạy Cell Ranger đã hoàn tất trong tháng này"
"Số lượng tế bào và số gen trung vị trên mỗi tế bào cho lần chạy scRNA-seq gần nhất của tôi là bao nhiêu?"
"Tải xuống ma trận đặc trưng-mã vạch đã lọc cho mẫu SRS_001"
"Chạy lại quy trình cho mẫu ID xyz với phiên bản hóa học 3"
"Liệt kê tất cả các bộ dữ liệu trong dự án Vi môi trường khối u"
"Lần chạy gần đây nào của tôi không đạt QC và lý do là gì?"
"So sánh độ bão hòa giải trình tự trong 5 lần chạy gần nhất của tôi"
"Thêm đồng nghiệp của tôi [email] làm cộng tác viên trong dự án Phiên mã không gian"
Mẹo chuyên nghiệp
Neotask trên Neotask có thể đối chiếu kết quả 10x Genomics Cloud với sổ tay phòng thí nghiệm hoặc công cụ phân tích hạ nguồn của bạn - yêu cầu nó tóm tắt một lần chạy và tự động thêm ghi chú vào Notion hoặc Google Doc của bạn
Đối với các nhóm thí nghiệm lớn, hãy yêu cầu tóm tắt theo lô thay vì truy vấn từng lần chạy - "cho tôi bảng tất cả các lần chạy trong quý này với số lượng tế bào và tỷ lệ ánh xạ"
Kết hợp với các tích hợp tính toán thông qua Neotask: kích hoạt quy trình 10x, giám sát nó và thông báo cho kênh Slack của bạn khi hoàn tất
Sử dụng truy vấn có cấu trúc để áp dụng ngưỡng QC: "hiển thị cho tôi tất cả các mẫu có độ bão hòa giải trình tự dưới 50%" phát hiện các lần chạy có vấn đề trước khi bắt đầu phân tích hạ nguồn
Multiple workspaces and capacity for larger teams.
Works Well With
Google Drive - Automate 10x Genomics data sync to Google Drive. Streamline genomics workflows, store research files in the cloud, and c...
Thêm tích hợp Giáo dục
italki language learning - Browse language teachers and book one-on-one or group lessons across more than 150 languages based on your schedule, level, and budget.
Coursera - Tìm kiếm, đăng ký và theo dõi việc học trên Coursera thông qua hội thoại - Neotask sử dụng Neotask để phát triển chuyên môn dễ dàng hơn.
Udemy - Tìm, đánh giá và theo dõi khóa học Udemy thông qua hội thoại tự nhiên - Neotask và Neotask giúp điều hướng thị trường khóa học lớn nhất thế giới một cách đơn giản.
ZZAIM - ZZAIM is aimed squarely at teachers working from Korea's official K-12 curriculum standards: it lets you search those standards by subject…
Duolingo - Tăng tốc thực hành Duolingo thông qua hội thoại - Neotask sử dụng Neotask để giúp bạn học ngôn ngữ nhanh hơn và thông minh hơn.
Google Classroom - Neotask tự động hóa quản trị Google Classroom - Neotask quản lý khóa học, bài tập và chấm điểm để giáo viên tập trung vào giảng dạy thay vì thao tác thủ công.